بر اساس اعلام سازمان امور مالیاتی کشور، اعمال معافیت و یا نرخ صفر برای موسسات خیریه و عام المنفعه، در صورت انجام تکالیف قانونی توسط اشخاص مذکور از جمله تسلیم اظهارنامه، ارایه اسناد و مدارک درخواست تعیین ناظر در موعد مقرر، در فرآیند رسیدگی جاری خواهد بود.
در بخشنامه ابلاغی سازمان امور مالیاتی کشور آمده است: چنانچه اشخاص مذکور، نسبت به انجام تکالیف قانونی خود از جمله تسلیم اظهارنامه، دفاتر و یا اسناد و مدارک و درخواست تعیین ناظر در موعد مقرر اقدام نموده باشند، عدم انتخاب ناظر و یا عدم ارایه گزارش از سوی ناظر، مانع از اعمال معافیت و یا نرخ صفر موضوع بند (ط) و تبصره (۱) ماده (۱۳۹) قانون مالیات‌های مستقیم در فرآیند رسیدگی نخواهد بود.
گفتنی است بند (ط) و تبصره (۱) ماده (۱۳۹) قانون مالیات‌های مستقیم بدین شرح است:
بند (ط) _ کمک‌ها و هدایای دریافتی نقدی و غیرنقدی موسسات خیریه و عام المنفعه که به ثبت رسیده‌اند، مشروط بر آن که به موجب اساسنامه آنها صرف امور مذکور در بند (ح) این ماده شود و سازمان امور مالیاتی کشور بر درآمد و هزینه آنها نظارت کند، از پرداخت مالیات معاف است.
تبصره (۱) – وجوهی که از فعالیت‌های غیر انتفاعی و به منظور پیشبرد اهداف و وظایف اشخاص موضوع این ماده از راه برگزاری دوره‌های آموزشی، سمینارها، نشر کتاب و نشریه‌های دوره‌ای و … در چارچوب اساسنامه آنها تحصیل می‌شود و سازمان امور مالیاتی کشور بر درآمد و هزینه آنها نظارت می‌کند، از پرداخت مالیات معاف است.
